一、信主之前(纸质图书和电子图书,王怡文库未收录):
1.《载满鹅的火车》,影评集,湖南美术,2002
2.《不服从的江湖》,杂文集,上海三联,2003
3.《美得惊动了中央》,自选文集,自行印刷,2024。
二、信主之后(作者审定,均为纸质图书,王怡文库收录电子图书):
1.《宪政主义,观念与制度的转捩》,学术专著,山东人民,2006
2.《天堂沉默了半小时》,影评集,江西人民,2007
3.《我有平安如江河》,影评集,江西人民,2008
4.《自由的崛起:16-18世纪加尔文主义与五个政府的形成》,译著(合译),江西人民,2008
5.《与神亲嘴》,自选文集,自行印刷,2008
6.《天堂沉默了半小时:电影中的信仰寻思》(未删节版),影评集,台湾宇宙光,2010
7.《一生一世的仰望:基督与生命系列访谈录》第一卷,访谈录,合著,台湾基文社,2010
8.《每周牧函:灵魂总动员》,牧函集,秋雨之福教会自印,2010
9.《我有翅膀如鸽子:基督与生命系列访谈录》第二卷,访谈录,合著,台湾基文社,2011
10.《每周牧函:天使的联邦》,牧函集,秋雨之福教会自印,2011
11.《观看中国城市家庭教会》,学术专著,合著,台湾基文社,2012
12.《灵魂深处闹自由》(《与神亲嘴》之二),自选文集,台湾基文社,2012
13.《每周牧函:归正的教育》,牧函集,秋雨之福教会自印,2012
14.《每周牧函:城市之光》,牧函集,秋雨之福教会自印,2013
15.《大教堂:二十年诗选》,自行印刷,2014
16.《基督教古典教育》,学术文集,合著,秋雨归正学堂等自印,2015
17.《你不想听到的好消息》,福音小册,圣约图书室自印,2016
18.《大声的默想》,自选文集,香港圣约,2017
19.《福音的政变:宗教改革沉思录》,自选文集,香港圣约,2017
20.《小要理》,诗歌集,自行印刷,2018
21.《灵魂总动员:牧会现场的灵修书信》,自选文集,香港圣约,2018
22.《政权与神权:中国家庭教会谈话录》,访谈录,合著,秋雨圣约教会自印,2018。
三、被捕之后(编辑编纂,除注明外均为电子书,王怡文库收录电子图书):
1.《王怡文集:基督是主——论政教关系》,编者匿名,对华援助协会刊发,2019
2.《王怡文集:恩典为王——谦卑的反对者》,编辑匿名,对华援助协会刊发,2020
3.《王怡文集:背负十架——中国家庭教会史》,编辑匿名,对华援助协会刊发,2020
4.《我的人生正抵达荣耀》,王怡牧师诗歌朗诵会诗歌集,众弟兄姊妹选编,秋雨圣工出版,2021
5.《背负十架:中国家庭教会史(1807年-2018年)》,纸质图书,温哥华信友堂出版,2022(已出版韩文纸质版)
6.《来一次属灵的交谈》,王怡牧师牧函分享会牧函集,王怡文库编辑部选编,秋雨圣工出版,2022
7. Faithful Disobedience, Writings, Wang Yi and Others, edited by Hannah Nation and J.D.Tseng, InterVarsity Press, 2022(纸质图书,王怡文库未收录,已出版德文纸质版)
8.《进入属灵的婚姻》,王怡牧师婚姻牧养分享会文集,王怡文库编辑部编选,秋雨圣工出版,2023
9.《在基督里有中心的人》,文集,中英文对照纸质图书,王怡文库编辑部选编和翻译,秋雨圣工出版,2023
10.《被上帝教育的人有福了》,王怡牧师与基督教教育座谈会文集,王怡文库编辑部编选,秋雨圣工出版,2024
11.《看得见的山上之城》,王怡牧师公共神学分享会文集,王怡文库编辑部编选,秋雨圣工出版,2025。